综合运输研究所成立于1959年,建制归属中国科学院，业务接受政府主管部门领导；1973年移交交通部（铁道、交通两部合并）；1978年国家经委恢复,即归属其领导；1988年至今隶属国家发展和改革委员会；一直是中国宏观经济管理领域唯一的从事综合性交通运输研究咨询机构。综合运输研究所的研究领域涵盖交通运输经济的各个方面,其中包括对国家和地区交通运输领域的中长期发展战略、规划布局、产业政策、各种运输方式的综合利用等研究；为地区、部门和跨国、跨地区企业的交通运输发展规划、管理模式、企业经营战略、项目发展方案等,提供权威决策参考；此外,在交通运输建设项目和运输方案等的评估、设计和咨询服务等方面具有丰富的经验。并获有国家授予的工程咨询甲级资质。